هم‌زمان با قدرت‌گيری دولت صفوی در ايران، يكی از نوادگان تيمور به نام ظهيرالدين محمدبابر در هندوستان قدرت را به‌دست گرفت. با وجود اين‌كه دو دولت بر سر مسئلۀ قندهار با يكديگر اختلاف داشتند و اين شهر چندبار ميان دو طرف دست به دست شد، اما در مجموع روابط آن‌ها حسنه بود.