باكتری‌های تثبيت كنندهٔ نيتروژن، به صورت آزاد در خاک يا همزيست با گياهان زندگی می‌كنند. نيتروژن تثبيت شده در اين باكتری‌ها به مقدار قابل توجهی دفع، و يا پس از مرگ آن‌ها برای گياهان قابل دسترس می‌شود. بررسی ساير گزينه‌ها: گزينهٔ «1»: ريزوبيوم‌ها با تثبيت نيتروژن، نياز گياه را به اين عنصر برطرف می‌كنند و گياه نيز مواد آلی مورد نياز باكتری را برای آن فراهم می‌كند. سيانوباكتری‌های همزيست درون ساقه و دمبرگ گياه گونرا، تثبيت نيتروژن انجام می‌دهند و از محصولات فتوسنتزی گياه استفاده می‌كنند. گزينهٔ «2»: ريزوبيوم‌ها فتوسنتز نمی‌كنند. گزينهٔ «4»: باكتری‌های تثبيت كنندهٔ نيتروژن، اين مولكول (نيتروژن) را به يون آمونيوم تبديل می‌كنند بنابراين، می‌توانند نيتروژن مورد نياز گياه را تأمين كنند.