از آنجا که هر پروتئینی توالی آمینواسیدی خاص خود را دارد؛ در نتیجه ساختار اول هر پروتئین منحصربه‌فرد است. از طرفی ساختار اول پروتئین در تعیین سایر ساختارهای پروتئینی نقش دارد؛ پس ساختار چهارم پروتئینی تحت تأثیر ساختار اول است و شکل خاص خود را دارد. از آنجا که توالی آمینواسیدی عمل پروتئین را تعیین می‌کند، پس هر پروتئین عمل خاص خود را دارد. بعضی پروتئین‌ها مانند هموگلوبین در ساختار خود بخش غیر آمینواسیدی دارند. بعضی از آنزیم‌ها هم در هسته فعالیت دارند.